แนะนำให้เก็บ Melanotan-II ที่อุณหภูมิ -20 องศา อุณหภูมิต่ำจะทำให้อัตราการเกิดปฏิกิริยาทางเคมีช้าลง และลดโอกาสที่จะเกิดปฏิกิริยากับปัจจัยด้านสิ่งแวดล้อม เช่น ออกซิเจนและความชื้น ซึ่งจะช่วยป้องกันการย่อยสลาย ออกซิเดชัน หรือการเน่าเสียในรูปแบบอื่น ๆ
ตรวจสอบให้แน่ใจว่าบรรจุภัณฑ์ปิดสนิทระหว่างการเก็บรักษาเพื่อป้องกันอากาศและความชื้นเข้าไป หลีกเลี่ยงการแช่แข็ง-วงจรการละลายซ้ำๆ เนื่องจากสิ่งเหล่านี้สามารถนำไปสู่การรวมตัวของเปปไทด์ กิจกรรมที่ลดลง หรือความเสียหายทางโครงสร้าง ซึ่งทั้งหมดนี้ส่งผลต่อประสิทธิภาพ หากจำเป็นต้องใช้หลายครั้ง ให้แบ่งผลิตภัณฑ์ออกเป็นส่วนเล็กๆ และดึงออกมาเพียงส่วนเดียวสำหรับการใช้งานแต่ละครั้ง
